В начало раздела
Home
В разделе представлены общие представления о грибах и заболеваниях, ими вызываемых, данные по выделению грибов в жилых помещениях.
В разделе рассматриваются патогенез, клиника и лечение этого одного из наиболее часто встречающихся микозов.
Раздел кандидоз посвящен заболеваниям, вызываемыми дрожжеподобными грибами рода Candida.
В разделе представлены более редкие микозы такие как зигомикоз (мукормикоз, споротрихоз), криптококоз, пенициллез, мицетомы.
Актиномикоз представляет не только диагностическую, но и лечебную проблему. Хотя это заболевание и не является истинным микозом оно рассматривается в микологическом разделе.
Отдельный раздел посвящен микозам кожи, в том числе онихомикозам, представляющим одно из самых массовых кожных заболеваний в стране и в мире.
Микозы в педиатрии также представлены в отдельном разделе, поскольку диагностика и терапия микозов у детей имеют свои особенности.
В разделе микогенная аллергия обсуждаются особенности клиники, диагностики и лечения аллергических заболеваний, индуцируемых грибами или продуктами их жизнедеятельности.
Описание противогрибковых препаратов, правила их назначения.
В отдельной рубрике представлено содержание журнала "Проблемы медицинской микологии", правила для авторов и условия подписки.
Научно-практические конференции по медицинской микологии
1x1.gif
В рубрике дана информация об этом единственном в стране специализированном институте, занимающимся проблемами медицинской микологии.
В рубрике представлены ссылки на основные микологические сайты в сети Интернет.
E-mail

Микологическая терминология, её использование на практике

Н.П. Елинов
Научно-исследовательский институт медицинской микологии Санкт-Петербургской медицинской академии постдипломного образования, Санкт-Петербург, Россия.

     Накопленные к XXI веку фактические данные по структурно-функциональной организации клеток микро- и макромицетов, их росту, размножению, развитию (онто- и филогенезу), по геному в целом, по экологии грибов и эпидемиологии микозов стали базой для уточнения систематического положения отдельных представителей микобиоты и существующих классификационных схем для них.

   Хорошо известно, что ещё Карл Линней (1707-1778) отнёс грибы и бактерии к царству растений, выделив их в группу «Низшие растения»[1], которая и теперь «фигурирует» в работах многих ботаников, микробиологов и, в том числе, микологов. Великий систематик также предложил биноминальную номенклатуру, согласно которой первое слово отражает название рода, второе слово - название вида.

   Различные характеристики грибов (как и других организмов), используемые теперь при определении принадлежности культур к определённой группе организмов, к уже известным или новым видам, более или менее чётко очерчены, достаточно многообразны и сравнительно надёжны. Однако избежать синонимики окончательно пока не удаётся. Из почти 800 ежегодно вновь описываемых видов грибов около 150-200 оказываются ранее известными, а их названия становятся синонимами.

   Биоразнообразие грибов в природе численно достаточно внушительное - по прогнозам систематиков [2] примерно около 1,5 млн., из которых изучено лишь порядка 4% [3].

   Составными частями систематики являются номенклатура, таксономия и классификация, из них таксономия представляет собой науку о классификации, но прежде, чем классифицировать объекты их надо хорошо изучить и отнести к определённым категориям - таксонам (видам, родам, семействам и т.д.). Номенклатура грибов - прерогатива Международного Кода ботанической номенклатуры и принимается на каждом Международном Ботаническом Конгрессе [4]. Последний по времени такой Конгресс состоялся в 1999 г. Любые предложения по изменению Кода публикуют в издании «Taxon», обсуждаются и принимаются/отвергаются голосованием на номенклатурной секции Ботанического Конгресса; на Конгрессе же назначают Комитет по грибам (Соmmittee for Fungi - сокращённо CF), в котором можно получить профессиональные ответы на соответствующие вопросы.  Код нацеливает на использование хорошо обоснованного принципа (метода) названия таксономических групп, не допуская и отвергая такие названия, которые могут индуцировать двусмысленность или ошибку, или, наконец, подталкивать науку о систематике к ложному направлению.

   Из многих проблем и задач в области систематики микроорганизмов мы останавливаемся на терминологии (номенклатуре) преимущественно медицински значимых микромицетов и вызываемых ими заболеваний в рамках Международного Кода ботанической номенклатуры.

   В Код включены 6 принципов, 62 статьи - предписания, не мандатные  рекомендации и различные приложения. Код позволяет предлагать для любого таксона многие корректные названия, поскольку они могут быть использованы при его дальнейшем включении в соответствующую классификационную схему.

   После принятия решения по таксономии гриба в Коде предусмотрены правила выработки того названия, которое должно быть применено на практике. Каждый таксон в таких позиции и ранге может иметь только одно номенклатурно корректное название, при выборе которого фильтром выступают 5 следующих действий:

1. признание публикации эффективной, если нет необходимости в дальнейшем обсуждении названий;

2. считать публикацию как имеющую силу; при этом также нет необходимости в дальнейшем обсуждении названий;

3. проведение типификации; названия могут быть исключены в силу их принадлежности другим грибам (как корректные названия или синонимы);

4. оценка законности названий, внесенных в список как синонимы;

5. оценка приоритетности названий, внесенных в список в качестве синонимов.

  • Чтобы признать публикацию о названиях эффективной, необходимо опубликовать её в журнале, книге и довести  до читателей или, по крайней мере, до ботанических учреждений в порядке обмена, продажи или презėнта.

  • Чтобы признать публикацию действенной, названия вновь описываемых таксонов одновременно должны отвечать следующим требованиям: иметь корректную форму, быть описанными на латинском языке (их диагнозы), быть принятыми самими  авторами и соответствовать любым подходящим специальным постановлениям, содержащимся в Коде; иметь чёткое определение ранга (категории) с указанием образца и места его консервации, быть зарегистрированным. Заменённые названия должны быть сопровождены полными библиографическими  деталями с указанием места публикации и цитированием заменённого названия или базионима (базинима, базонима), то есть имя- или эпитетнесущего сионима, на котором основывается новый перенос или новая комбинация. Не опубликованные названия (nomen invalidum) не обсуждаются.

  • Связь каждого названия с номенклатурным типом является основным принципом стабильности в применении названий. Все ранги - от семейства и ниже безусловно базируются на одной коллекции; например, Cryptococcaceae - на Cryptococcus - на C. neoformans в одной коллекции.

    Типовые образцы культур должны сохраняться в метаболически не активном состоянии (например, лиофильно-высушенными, в жидком азоте) или в виде микропрепаратов; активно растущие культуры не допускаются. Если образец не может быть предохранён, то допустимо его изображение или описание. В случае, когда типовая коллекция оказывается смешанной, то одна часть её должна быть отобрана в качестве лектотипа (то есть формы, отобранной в последней работе с оригинальным материалом, в котором не был обнаружен голотип; голотип - это одиночный элемент, использованный автором в качестве базового для выбора названия, например, красный цвет у представителей рода Rhodotorula).

  • Действительно опубликованные названия, не соответствующие определённым положениям Кода, являются незаконными (nomen illegitimate) и они должны быть отвергнуты; примеры: а) название уже было использовано ранее, б) названия гомонимичны, когда слова сходны по звучанию, но различны по значению (сравнить английские bare - голый и bear - медведь [‘bεə] и [bɛə]  или латинские annus - год и anus - кольцо).

  • Приоритетность публикации определяет корректное название таксона. Корректное название вида (то есть название в соответствии с требованиями Кода) - это есть комбинация самого раннего лигитимного эпитета в том же ранге в соответствии с родовым названием. Это можно изменить, если генерическое (родовое) положение или  ранг изменяется, то есть вид может иметь больше, чем одно корректное название согласно различным классификациям. Грибы с плеоморфным состоянием в их жизненном цикле приобретают отдельные названия. Корректное название голоморфы есть название телеоморфы.

       Таковы в кратком изложении рамки Международного Кода ботанической номенклатуры. Принятые ранги в номенклатурной иерархии представляются следующим образом [5-7]:

    Домен (Надцарство - Н.Е.) ....................................Eukaryota

    Царство ...................................................................Fungi                                                                                                                             

    Подцарство ............................................................*

    Филум (Отдел)........................................................Basidiomycota

    Субфилум (Подотдел)............................................Basidiomycotina*

    Класс........................................................................Basidiomycetes

    Подкласс..................................................................                  - tide *

    Порядок....................................................................Tremellales

                                                                                            Ustilaginales и др.**

    Подпорядок.............................................................          - ineae*

    Семейство................................................................Cryptococcaceae***

    Подсемейство..........................................................                - oideae*

    Триба........................................................................                   - ieae *

    Субтриба..................................................................                   - inae *

    Род............................................................................Cryptococcus

    Подрод..................................................................... Cryptococcus*

    Секция......................................................................*

    Подсекция................................................................*

    Серия........................................................................*

    Подсерия..................................................................*

    Вид............................................................................Cryptococcus neoformans

    Подвид......................................................................*

    Вариант.....................................................................Cryptococcus neoformansvar.neoformans

          Подвариант...............................................................*

    Форма........................................................................*

    Подформа..................................................................*

    Специальная форма..................................................*

    Физиологическая раса..............................................*

      Примечания: * не обязательно для избранного криптококка

                           ** происхождение криптококков полифилетическое

                         *** для анаморфных криптококков

      Многолетнее использование ряда терминов специалистами различных профилей, причастных или непричастных к медицинской микологии, способствовало «прочному укоренению» ряда названий, независимо от пересмотра некоторых положений в систематике грибов, таксономии и в классификационных схемах. Это, в частности, касается и криптококков.

       Виттакер (Wittaker, 1969)[8] выделил грибы в самостоятельное царство, хотя и ранее многие учёные предлагали сделать то же самое. Очевидно, недостаточная фактическая аргументация оказывалась сдерживающей в принятии подобного решения большинством систематиков. Ныне положение изменилось, и Regnum (Царство) Fungi обоснованно заняло подобающее ему место среди других Царств. Грибы - слизевики отнесены к Protozoa, создано Царство Chromista, включающее гифохитриомицеты, лабиринтуломицеты и оомицеты; аскомицетовые, базидиомицетовые, хитридиомицетовые и зигомицетовые грибы отнесены к Царству Fungi .    

    Следовательно линнеевская группа «Низшие растения» в Царстве растений упразднена по необходимости и целесообразности. Это кардинальное положение в микологии не нашло должного отражения в монографиях, учебниках, научных и научно-методических публикациях в Росси и в ряде зарубежных стран.

       В течение 15 лет в выступлениях на заседаниях научных обществ, в лекциях, читаемых различным категориям слушателей, в публикациях [9-13] мы предпринимали попытки совершенствовать микологическую терминологию, и, прежде всего, применительно к медицинской микологии. Происходят некоторые подвижки в этом направлении среди молодых и зрелых микологов, однако этого ещё недостаточно. Поэтому данная публикация нацелена на привлечение более широких кругов специалистов - микробиологов, включая микологов, врачей различных специальностей, биологов (в том числе - ботаников) и других к использованию единой, рациональной, научно-обоснованной микологической терминологии, не выходя за рамки требований Международного Кода по номенклатуре. В случае возникновения дискуссионных вопросов, каких-либо предложений по указанной проблеме, редакция журнала «Проблемы медицинской микологии» согласна предоставить возможность авторам опубликовать такие материалы.

       Какие же микологические термины необходимо трансформировать с учётом произошедших в микологии изменений? Ниже назван ряд из них в таблице.

     

    Таблица

    Микологические термины, подлежащие трансформации

                                                                                                                                   
    Название (Nomen)
    устаревшее (obsoletus) новое (novum) трансформированно
    АльтернариамикозАльтернариоз
    Базидиоболомикоз                           Базидиоболёз
    Вангиелламикоз                               Вангиеллёз
    Дерматофитоз                                  Дерматомикоз
    Дерматофиты                                   Дерматомицеты
    Дисбактериоз*Дисбиоз
    Зигомикоз (!?) Это могут быть: Абсидиоз, Конидиоболёз, Мукороз, Ризопоз
    Кандидамикоз                                   Кандидоз
    Кандидиаз       Кандидоз
    Кандидиазис                                     Кандидоз
    Кокцидиоидный микоз                    Кокцидиоидоз
    Микроспория                                    Микроспороз
    Пенициллёз                                    Пенициллиоз
    Споротрихоз                                     Споротриксоз
    Эпидермофития                                Эпидермомикоз

    Из таблицы следует:

    1. в словосочетаниях, содержащих корневое слово “фитон” (по-лат. phyton - растение) необходимо заменять на слово «микоз», если это не противоречит правилам ботанического кода; так, вместо слова «дерматофиты» следует писать (говорить) «дерматомицеты»; необходима замена терми-на «сапрофиты» на «сапробы» (сапротрофы, сапробионты); то же приложимо и к слову «флора» (совокупность видов растений), когда вместо «мико- и/или микрофлоры» необходимо пользоваться словосочетаниями «микобиота и/или микробиота», то есть слово «флора» заменяют соот-ветственно на слово «биота»;

    2. патологические процессы, индуцируемые грибами, должны иметь в названиях окончания «оз» или «ёз», например  аспергиллёз, кандидоз, пенициллиоз, фузариоз и т. д., то есть окончания преимущественно в латинских названиях родов грибов - патогенов трансформируются в окончания «оз(ёз)», например, Aspergillus - Аспергиллёз, Candida - Кандидоз, Penicillium - Пенициллиоз и т. п.; здесь допустимы исключения из этого правила, когда окончание «оз(ёз)» добавляется к родовому названию патогена, заканчивающемуся согласной буквой, например, Sporothrix - Споротриксоз (ранее было Sporothrichum - Споротрихоз);

    3. вместо обобщающего, правильно обозначающего группу заболеваний, слова «зигомикозы» необходимо использовать название конкретного заболевания, например, абсидиоз, ризомукороз и т. д.; если видовая принадлежность патогена временно не определена, тогда возможно использование слова «зигомикоз»;

    4. патологический процесс, называемый «дисбактериозом», необходимо относить только к пациентам, у которых отмечают нарушения в составе бактериобиоты; если же речь идёт о лицах, у которых выявлено нарушение нормобиоты, обусловленное грибами (грибками), то следует говорить (писать) о «дисбиозе».

       В различных зарубежных публикациях [10, 14, 15] достаточно широко используют такие термины, как «гиалогифомицеты» и «феогифомицеты»; первые из них не окрашенные, вторые - тёмно-окрашенные (обычно относимые к группе Dematiaceae). Следует подчеркнуть, что греческое слово hýalos - стекло и латинское hyalinum - стекловидный мало соответствуют истинной окраске большинства грибов - микромицетов в культурах на питательных средах, которые, даже при начальном росте, являются белыми (в таком же возрасте и зрелые тёмно-окрашенные грибы также оказываются белыми до периода спорообразования). Поэтому более точным и, следовательно, более правильным такие грибы обобщённо именовать «Лейкогифомицетами» (от греч. и лат. leukos - белый).

       Феогифомицеты , как тёмно-окрашенные грибы (Alternaria sp., Bipolaris sp., Exerohilum sp., Fonsecaea sp., Exophiala sp., Phialophora sp., Phoma sp., Wangiella sp., Xylohypha sp.) могли бы быть названы опакомицетами или фускомицетами (по-лат. opacus и fuscus - тёмный). Следовательно, при первом выборе термина необходимо учитывать точное его соответствие описываемому признаку, а также удобство и лёгкость произношения термина на разных языках. В этом смысле наиболее соответствующим названным признакам является слово «Опакогифомицеты». Мы предлагаем, с учётом хронологии выдвинутых предложений, использовать в подобных случаях термин «Опако(фео)гифомицеты», сохраняя «фео» до поры, до времени (nomen provisorum) как синоним.

       Таким образом, назревшие вопросы в области микологической терминологии должны привлечь внимание самого широкого круга научных и практических работников, причастных к грибам (особенно - медицински значимым) в своей профессиональной деятельности. Использование научно-обоснованных терминов диктуется состоянием науки о микро- и макромицетах.

                                     Литература

    1. Linné K. Systema Naturae. -1767. - P. 683, 722.

    2. Fungi species head for oblivion // Nature. - 1996. -Vol. 381. - № 6578. - P. 106

    3. Калакуцкий Л.В. 7-й Междунар. Конгресс коллекций культур // Ж. Микробиология РАН. - 1993. - Т. 62. - в. 3. - С. 363-366.

    4. Greuter et. al.(Eds.). Regnum veget. - 1994. - Vol. 131.

    5. Hawksworth D.L., Kirk P.M., Sutton B.C. and Pegler D.N. with assistance oths. Ainsworth & Bisby’s dictionary of the Fungi. 8th ed. - 1995. Reprinted. -1996. - P. 313-315.

    6. The Yeasts. A taxonomic study. 4th revised and enlargent edition. C.P. Kurtzman, J.W. Fell (Eds.). ELSEVIER SCIENCE B.V. - Amsterdam. Netherlands. - 1999. - 1055 p.

    7. Елинов Н.П., Васильева Н.В. Род Cryptococcus в четвёртом издании «The Yeasts» (A taxonomic study) // Ж. - Проблемы медицинской микологии. 2000. - Т.2. - № 3. - С. 6-11.

    8. Wittaker R..H. New concepts of Kingdoms of organisms // Science. - 1969. - Vol. 63. - P. 150-160.

    9. Елинов Н.П. В Европейской Конфедерации по медицинской микологии (ЕКММ) // Ж. Проблемы медицинской микологии. - 1999. - Т. 1. - № 3. С. 46-47.

    10. Елинов Н.П. «Грибковая инфекция» (Карманный путеводитель). М.Д.  Ричардсон и Э.М. Джонсон. Рецензия // Ж. Проблемы медицинской микологии. - 2000. - Т. 2. - № 1. - С. 67.

    11.Елинов Н.П. Candida species и кандидемия. Состояние проблемы (обзор). // Ж. Проблемы медицинской микологии. - 2001. - Т. 3. - № 1. - С. 4-15.

    12.Елинов Н.П., Васильева Н.В. Рецензия на атлас клинически значимых грибов под ред. Г.С. дe Хоога и Дж. Гуарро// Ж. Проблемы медицинской  микологии. - 1999. - Т. 1. - № 2. - С. 51-55.

    13. Елинов Н.П. Противовоспалительные, антисептические и химиотерапевтические средства. В кн. Современные лекарственные препараты (справочник с рецептурой). Авторы Н.П. Елинов и Э.Г. Громова. 2-е изд. - 2000. - С. 591-595.

    14. Manual of Clinical Microbiology. 5th ed. A. Ballows at al. (Eds.). Amer. Soc. for Microbiology. - 1991. - P. 579 -700.

    15. Kwong-Chung K.J. , Bennett J.E. Medical Mycology. Lea & Febiger. Philadelphia and London. - 1992. 


    •   В начало раздела